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        蛋白質印跡(Western Blot)保姆級教程 Part 2:解決WB的疑難雜癥

        更新時間:2024-08-09   點擊次數:680次

        ?背景有黑點,怎么辦??詳情信息

        1、封閉液未溶完-全-
        解決:
        A.確認BSA/牛奶有完-全溶解,建議增加溶解時間或溶解后取上清液使用。
        B.利用0.45um濾紙過濾溶液,也可使用商品化試劑,如GTX30964(Trident Universal Protein Blocking Reagent,適用于WB、IHC、ICC/IF、ELISA)。

        C.改變緩沖液,如換為BSA。


        2、溶液污染
        解決:

        使用現配的溶液(Running/transfer/blocking/wash buffers)或商業化溶液減少因長菌長霉造成的黑點。


        3、封閉液及抗體交互作用

        解決:
        一般脫脂牛奶中含有casein這種磷酸蛋白,可能會與磷酸化抗體產生非特異性結合。因此,如使用磷酸化抗體,建議用BSA作為封閉溶液,同時洗脫溶液也用TBST,如此可降低黑點高背景的情況。


        ?過曝,怎么辦??詳情信息
        1、蛋白樣品過量
        解決:

        降低蛋白上樣量,通常蛋白上樣量為30-50ug,但有些蛋白表達量較高(如β-actin),此時可依蛋白表達量,進行微調。


        2、抗體過量
        解決:
        A.增加抗體稀釋倍數。
        B.減少孵育時間,一般孵育時間為37℃,1小時。

        C.于4℃過夜孵育,減少抗體非特異性結合。


        3、訊號過曝
        解決:
        A.縮短曝光時間。
        B.使用低靈敏的ECL。


        ?拖帶,怎么辦??詳情信息
        1、樣品不純,有雜質污染
        解決:
        A.重新離心樣品,取上清液使用。
        B.使用較純的試劑配制細胞裂解液或購買商業化產品。
        C.使用Benzonase®核酸酶,Benzonase®核酸酶能迅速水解核酸,降低蛋白樣品粘度,減少核酸對跑膠的干擾。

        D.全細胞或亞細胞萃取,使用商業化全細胞或亞細胞萃取試劑盒提取蛋白樣品,減少配制試劑溶液以及操作中分離不干凈的問題。


        2、蛋白樣品過量
        解決:
        A.降低蛋白上樣量,通常蛋白上樣量為30-50ug,但有些蛋白表達量較高(如beta actin),此時可依蛋白表達量,進行微調。

        B.蛋白變性不完-全,也會使條帶成團拖曳;此時,可通過延長樣品加熱時間(一般約5分鐘)及調整SDS(一般是2 %)比例,使蛋白變性更完-全。


        3、訊號過曝
        解決:
        A.縮短曝光時間。
        B.使用低靈敏的ECL。


        ?條帶扭曲,怎么辦??詳情信息
        1、膠沒配好
        解決:
        A.確保APS&TEMED正常,并新鮮配制膠體。

        B.空的泳道加Sample Buffer


        2、電流電壓問題
        解決:

        避免膠體過熱。電壓過高也會出現微笑、歪斜條帶等條帶,建議上層濃縮膠使用80V;下層分離膠使用100-120V。另外也需檢查電泳槽是否有銹蝕造成電流不穩。過熱時可改為在冷室或者冰浴中進行電泳。


        3、轉膜問題
        解決:
        小心滾壓膠體并確保與膜貼合,有時出現 2個條帶是因為轉膜時不小心移動到膜產生疊影。


        ?高背景,怎么辦??詳情信息
        1、封閉問題
        解決:
        A.確認封閉完-全。封閉作用不足,這是其中一種可能的原因,提高封閉物濃度可確保封閉液完-全覆蓋轉印膜,如使用5% 脫脂奶粉或BSA。
        B.封閉液不與抗體反應。這種情況較常發生在磷酸化抗體的使用過程中,由于牛奶含有casein這種磷酸蛋白,因此如果使用牛奶當封閉液,封閉液與磷酸化抗體可能會產生非特異性的結合。這個情況下,建議使用BSA作為封閉液,同時搭配使用TBST的洗脫液來幫助降低高背景值的狀況。

        C.封閉時間增加,一般情況會使用室溫37度封閉1小時,可視情況調整封閉的條件。


        2、膜的問題
        解決:
        A.選擇合適的膜(可參考詳情信息)
        B.膜干掉,建議整個實驗過程都須注意讓膜保持濕潤,特別是PVDF膜。

        C.膜沒有完-全均勻濕透,PVDF膜較會出現這個狀況,使用PVDF膜前,需用100% methanol完-全浸潤膜。


        3、抗體問題
        解決:
        A.降低抗體濃度
        B.以陽性對照確認二抗

        C.足夠的洗脫時間和次數


        4、呈色問題
        解決:
        ECL呈色問題造成高背景值的原因,可能是因為化學顯色底物過多;建議按說明書加入適量的顯色底物。


        ?非特異性條帶,怎么辦??詳情信息
        1、蛋白降解
        解決:
        A.加蛋白酶抑制劑或磷酸酶抑制劑,避免蛋白降解。
        B.冰上操作。

        C.避免反復凍融樣品(建議分裝);建議使用新鮮制備的樣品。


        2、蛋白形成多聚體

        解決:
        A.使用現配的DTT/2-ME并將加熱時間延長,幫助打斷多聚體的雙硫鍵。

        B.樣本煮沸溫度達到95℃-100℃。


        3、確認蛋白特性
        解決:

        查詢生物信息是否有后修飾、剪切體等。


        4、抗體濃度過高/蛋白樣品過量
        解決:
        A.增加抗體稀釋倍數,也可調整孵育時間,并在4℃孵育。

        B.減少上樣量。


        5、抗體非特異性結合
        解決:
        A.增加洗膜次數與時間或在洗滌液里改用不同強度的detergent或是增加濃度。

        B.設對照組來確認抗體非專一性結合可能的原因,例如:是否有目標蛋白表達。


        6、抗體檢測到heavy/light chain的信號
        解決:
        這種情況通常發生在IP實驗里,GeneTex有一系列可避免辨認heavy/light chain的特制二抗,其設計原理是用來辨認native的一抗結構。(可參考詳情信息)




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